福建跨境通电子商务有限公司成立于2015年4月9日，由平潭综合实验区管委会联合福建省交通集团、福州海关、福建检验检疫、省邮政集团以及台湾关贸网路共同出资创办。

公司位于福州市平潭县，以运营跨境电子商务平台为核心业务，通过整合保税区政策与跨境电商服务，推动两岸经贸往来。作为福建省首家开展海关总署批准的跨境电商试点企业，该公司重点建设海峡跨境电子商务产业园区，提供报关、仓储、物流等一站式服务。